高通量测序样本质量检测

检测项目

DNA完整性、RNA完整性（RIN值）、OD260/OD280比值、OD260/OD230比值、核酸浓度（ng/μL）、蛋白质残留量、多糖污染值、游离核苷酸含量、pH值测定、电泳条带分布分析、荧光染料结合效率、片段大小分布（bp）、GC含量偏差率、外源DNA污染筛查、内毒素水平（EU/mL）、RNase活性检测、DNase活性检测、微生物菌落总数、重金属离子残留（Pb⁺/Cd⁺）、有机溶剂残留（乙醇/苯酚）、磁珠残留量评估、文库片段峰型分析、接头二聚体比例、PCR重复序列比例、测序接头浓度（pM）、文库复杂度评估、分子标签有效性验证、低质量碱基比例（Q20/Q30）、嵌合体序列比例、重复读序率

检测范围

全血样本、血清/血浆样本、新鲜组织切片（肿瘤/正常）、FFPE石蜡包埋组织、单细胞悬液、细胞培养物（贴壁/悬浮）、植物叶片/根茎提取物、土壤微生物宏基因组样本、粪便宏基因组样本、口腔拭子采集物、羊水穿刺样本、脑脊液样本、尿液沉渣样本、精液样本、毛发毛囊提取物、植物种子胚乳组织、昆虫外骨骼甲壳素样本、海洋生物软组织样本、细菌培养液（革兰氏阳性/阴性）、真菌菌丝体提取物、病毒颗粒悬液（DNA/RNA病毒）、质粒DNA溶液PCR产物纯化液cDNA文库构建产物mRNA富集产物miRNA小RNA片段cfDNA循环游离DNA甲基化修饰DNA样本人工合成寡核苷酸环境水体过滤物食品基质残留物法医陈旧性生物检材

检测方法

1.分光光度法：采用紫外-可见分光光度计测定OD260/OD280/OD230吸光度值，计算核酸纯度与浓度2.荧光定量法：基于Qubit荧光染料特异性结合双链DNA/RNA的特性进行精确定量3.琼脂糖凝胶电泳：通过核酸片段迁移速率评估DNA完整性及片段大小分布4.毛细管电泳系统：利用Agilent2100/4200分析仪实现高分辨率核酸片段分析5.qPCR扩增效率法：通过标准曲线法定量功能性DNA模板浓度6.数字PCR技术：绝对定量低丰度靶标分子并验证文库有效性7.酶标仪比色法：采用BCA/PicoGreen试剂盒测定蛋白质污染水平8.电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）：精确测定重金属离子残留量9.气相色谱-质谱联用（GC-MS）：分析有机溶剂残留成分及浓度10.流式细胞术：评估单细胞悬液活率及细胞团块比例

检测标准

GB/T30988-2014《高通量测序技术规程》ISO/IEC17025:2017《检测和校准实验室能力的通用要求》YY/T1596-2017《人类外周血个体基因识别检测通用技术要求》CLSIMM19-A2《分子诊断标本采集与处理指南》ISO20395:2018《生物技术-核酸定量方法效能要求》GB/T37873-2019《生物样品中微生物菌群宏基因组测序分析方法》ENISO22118:2021《食品微生物学-高通量测序技术应用指南》FDAGuidanceforIndustry:BioanalyticalMethodValidationICHQ2(R1)《分析方法验证技术要求》ISO14644-1:2015《洁净室及相关受控环境国际标准》

检测仪器

1.NanoDropOne/OneC微量分光光度计：适用于1-2μL微量样本的快速纯度与浓度分析2.Qubit4.0荧光定量仪：采用Invitrogen专有染料实现高灵敏度核酸定量3.Agilent4200TapeStation系统：自动化电泳平台提供RIN值及DV200指数计算4.Bioanalyzer2100生物分析仪：通过微流控芯片技术完成pg级RNA/DNA质控5.QuantStudio7Pro实时定量PCR系统：验证文库扩增效率及污染筛查6.MiSeqFGx法医基因组学测序仪：专用法医检材质量控制平台7.CovarisM220聚焦超声破碎仪：标准化DNA片段化处理过程监控8.BeckmanCoulterCytoFLEX流式细胞仪：单细胞测序前细胞活性评估9.ThermoFisherOrbitrapExplorisGC-HRMS：高分辨质谱分析小分子污染物10.IlluminaNovaSeq6000系统配套质控模块：实时监测流动槽加载浓度

检测服务范围

1、指标检测：按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享：按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析：对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4，样品前处理：对产品进行预处理后，进行样品前处理，包括样品的采集与保存，样品的提取与分离，样品的鉴定以及样品的初步分析，通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析：根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测，然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。

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