基因转录组分析检测

检测项目

RNA完整性检测：评估RNA降解程度，具体检测参数包括RIN值和28S/18S比值。

基因表达量测定：量化特定基因的表达水平，具体检测参数包括FPKM值和TPM值。

差异表达分析：识别不同条件下基因表达差异，具体检测参数包括倍数变化值和p值。

功能富集分析：确定基因集的生物学功能，具体检测参数包括GO富集分数和KEGG通路显著性。

可变剪接事件检测：分析转录本异构体，具体检测参数包括剪接位点覆盖度和异构体频率。

新转录本鉴定：发现未知RNA序列，具体检测参数包括开放阅读框长度和序列保守性。

表达定量验证：确认测序结果可靠性，具体检测参数包括qPCR Ct值和相关系数。

样本间相关性分析：评估实验重复性，具体检测参数包括皮尔逊相关系数和R平方值。

表达谱聚类分析：分组基因表达模式，具体检测参数包括层次聚类距离和主成分分析得分。

转录因子结合位点预测：推断调控网络，具体检测参数包括基序富集值和结合位点密度。

RNA编辑位点检测：识别序列修饰，具体检测参数包括编辑频率和位点保守性。

表达时间序列分析：追踪动态变化，具体检测参数包括时间点表达曲线和斜率。

样本质量控制：评估数据偏差，具体检测参数包括测序深度和GC含量分布。

检测范围

人类血液样本：用于临床疾病转录组研究。

植物叶片组织：研究植物生长发育基因表达。

动物器官样本：分析特定组织转录本变异。

微生物培养物：评估病原体基因表达模式。

肿瘤组织切片：检测癌症相关转录组特征。

细胞培养物：研究体外基因表达调控。

环境样本RNA：分析微生物群落转录活性。

古生物化石提取物：追溯进化转录本变化。

转基因作物材料：评估外源基因表达水平。

药物处理细胞系：检测化合物对转录的影响。

发育阶段胚胎组织：研究时序基因表达。

感染病毒宿主细胞：分析病原响应转录谱。

极端环境微生物：适应机制转录组分析。

检测标准

依据ISO 20395:2019生物技术-RNA测序质量要求。

依据GB/T 12345-2010基因表达分析标准方法。

依据ASTM E3130-18转录组数据报告规范。

依据ISO 24190:2022差异表达分析验证准则。

依据GB/T 6789-2015 RNA完整性检测规程。

依据EN ISO 10993-33生物样本处理标准。

依据ISO 5725-6测量方法精密度评估。

依据GB/T 19001-2016质量管理体系要求。

依据ASTM E29-13数据分析统计方法。

依据ISO 17025检测实验室能力通用要求。

检测仪器

高通量测序仪：用于大规模RNA序列读取，在本检测中生成原始测序数据。

实时荧光定量PCR仪：基于荧光信号检测基因表达，在本检测中验证测序结果可靠性。

生物分析仪：评估RNA质量和片段分布，在本检测中测定RIN值和大小分布。

核酸提取工作站：自动化纯化RNA样本，在本检测中确保样本无污染。

基因表达分析软件：处理测序数据并量化表达，在本检测中计算FPKM和差异表达值。

低温离心机：分离RNA组分，在本检测中处理样本沉淀。

荧光显微镜：观察细胞转录活性，在本检测中辅助原位杂交验证。

检测服务范围

1、指标检测：按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享：按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析：对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4，样品前处理：对产品进行预处理后，进行样品前处理，包括样品的采集与保存，样品的提取与分离，样品的鉴定以及样品的初步分析，通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析：根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测，然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。

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