全基因组甲基化测序
发布时间:2025-12-29
全基因组甲基化测序是一种用于分析生物样本全基因组范围内DNA甲基化修饰的高通量技术。该检测通过亚硫酸氢盐处理结合高通量测序,精确识别5-甲基胞嘧啶位点。检测过程涵盖文库构建、测序、数据质控及生物信息学分析,结果可用于表观遗传学研究、疾病标志物筛查及发育生物学分析。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
DNA提取与质控:从各类生物样本中分离高质量基因组DNA,通过紫外分光光度法和荧光定量法检测DNA浓度、纯度及完整性,确保符合建库要求。
亚硫酸氢盐转化处理:使用亚硫酸氢盐将未甲基化的胞嘧啶转化为尿嘧啶,而甲基化胞嘧啶保持不变,为后续测序提供基础模板。
全基因组文库构建:将经转化的DNA片段化后连接测序接头,通过PCR扩增富集目标片段,构建可用于高通量测序的DNA文库。
高通量测序:采用二代测序平台对文库进行双端测序,获得覆盖全基因组的原始序列数据,确保足够的测序深度和覆盖度。
原始数据质量控制:对测序产生的原始数据进行质量评估,包括碱基质量分布、接头污染检测及序列重复率分析。
序列比对与定位:将质控后的序列与参考基因组进行比对,识别每条读段在基因组中的精确位置。
甲基化位点识别:通过比对序列中胞嘧啶与胸腺嘧啶的转换情况,在全基因组范围内鉴定5-甲基胞嘧啶的具体位点。
甲基化水平定量:计算每个CpG位点或区域的支持读段数及甲基化胞嘧啶比例,获得定量甲基化水平数据。
差异甲基化区域分析:通过统计学方法比较不同样本组间甲基化水平的显著性差异,识别差异甲基化区域。
功能富集与通路分析:将差异甲基化区域注释到相关基因启动子区或功能元件,进行基因功能及信号通路富集分析。
检测范围
人类外周血白细胞DNA:用于疾病表观遗传标志物筛查及群体遗传学研究,需确保样本新鲜度及无溶血现象。
动物组织标本:包括哺乳动物器官组织及胚胎样品,适用于发育生物学及比较表观遗传学分析。
植物基因组DNA: 涵盖农作物叶片及种子组织,用于植物表观遗传调控机制及抗逆性研究。
检测服务范围
1、指标检测:按国标、行标及其他规范方法检测
2、仪器共享:按仪器规范或用户提供的规范检测
3、主成分分析:对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。
4,样品前处理:对产品进行预处理后,进行样品前处理,包括样品的采集与保存,样品的提取与分离,样品的鉴定以及样品的初步分析,通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;
5、深度分析:根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测,然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。
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