基因编辑效率验证实验
发布时间:2025-12-29
基因编辑效率验证实验是评估基因编辑工具如CRISPR-Cas9系统在特定靶点引入预期遗传修饰成功率的关键环节。该实验通过多种分子生物学技术,精确量化编辑事件的发生频率,分析脱靶效应,并确认编辑结果的准确性,为后续功能研究提供可靠的数据支持。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
靶向测序深度分析:利用高通量测序技术对目标基因区域进行深度测序,统计插入缺失和单核苷酸变异的频率与类型。
T7核酸内切酶I错配切割 assay:基于T7核酸内切酶I能够识别并切割不完全匹配的DNA双链的原理,快速评估样本中的基因编辑效率。
限制性内切酶片段长度多态性分析:通过设计使编辑位点产生或消除特定限制性内切酶酶切位点,通过电泳条带变化判断编辑是否发生。
数字PCR绝对定量:采用微滴式或芯片式数字PCR技术对编辑后的等位基因进行绝对定量,获得精确的编辑等位基因丰度。
流式细胞术分析:当基因编辑与报告基因或表面标志物表达相关联时,利用流式细胞术分选和计数成功编辑的细胞群体。
Western Blotting蛋白水平验证:检测目标蛋白的表达水平或分子量变化,从蛋白质层面确认基因敲除或敲入的效果。
细胞克隆形成 assay:通过有限稀释法获得单细胞克隆,扩增后对单个克隆进行基因型鉴定,计算具有纯合或杂合编辑的克隆比例。
脱靶效应评估:通过全基因组测序或在预测的潜在脱靶位点进行靶向测序,系统分析基因编辑工具的特异性。
Sanger测序与色谱图分析:对PCR扩增产物进行Sanger测序,通过序列色谱图的峰形重叠情况初步判断是否存在混合基因型。
原位杂交检测:利用标记的核酸探针在细胞或组织原位检测特定DNA或RNA序列的变化,确认编辑事件的空间定位。
检测范围
CRISPR-Cas9系统编辑的细胞系: 涵盖经过CRISPR-Cas9质粒、核糖核蛋白复合物等方式处理的永生化细胞系和原代细胞。
TALEN编辑器处理的生物样本: 包括使用转录激活因子样效应物核酸酶进行基因组修饰的各种动植物细胞和组织样本。
锌指核酸酶诱导的突变体: 针对利用锌指核酸酶技术构建的基因敲除或定点整合的模型生物体及其衍生细胞。
基础科学研究用基因修饰模型: 适用于实验室环境下为研究基因功能而创建的各类转基因、基因敲除或条件性敲除动物模型。
检测服务范围
1、指标检测:按国标、行标及其他规范方法检测
2、仪器共享:按仪器规范或用户提供的规范检测
3、主成分分析:对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。
4,样品前处理:对产品进行预处理后,进行样品前处理,包括样品的采集与保存,样品的提取与分离,样品的鉴定以及样品的初步分析,通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;
5、深度分析:根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测,然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。
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