质谱法蛋白质组学分析

检测项目

蛋白质鉴定：通过分析肽段的质量和碎片信息，与数据库比对，确定样品中蛋白质的种类和身份。

蛋白质定量：比较不同样品（如疾病与正常）中蛋白质的表达丰度差异，分为标记和非标记定量。

翻译后修饰分析：鉴定蛋白质发生的磷酸化、糖基化、乙酰化等化学修饰，揭示其功能调控机制。

蛋白质相互作用：通过亲和纯化结合质谱分析，鉴定与目标蛋白相互作用的蛋白网络。

蛋白质从头测序：在缺乏数据库信息时，直接利用串联质谱数据推导未知蛋白质的氨基酸序列。

亚细胞定位分析：结合细胞组分分离技术，鉴定特定细胞器或亚细胞结构中的蛋白质组成。

生物标志物发现：通过大规模筛选临床样本，寻找与疾病诊断、预后或疗效相关的特征性蛋白质分子。

蛋白质组深度覆盖：旨在最大程度地鉴定和定量一个复杂样本（如细胞、组织）中的所有蛋白质。

绝对定量分析：使用已知浓度的同位素标记标准肽段，精确测定目标蛋白质的绝对拷贝数或浓度。

蛋白质结构表征：利用氢氘交换质谱等技术，探测蛋白质的高级结构、构象变化及动态特性。

检测范围

全细胞裂解液：分析整个细胞的蛋白质组，获得全局性的蛋白质表达谱信息。

组织样本：包括新鲜冷冻组织、石蜡包埋组织等，用于研究组织特异性或病理状态下的蛋白质组。

血浆/血清：重要的临床样本类型，是发现循环生物标志物的主要来源，但复杂度高。

尿液、脑脊液等体液：无创或微创获取的样本，适用于特定疾病的生物标志物研究。

外泌体等细胞外囊泡：分析其携带的蛋白质 cargo，用于细胞间通讯和疾病机制研究。

特定细胞器：如线粒体、细胞核、高尔基体等分离后的组分，进行空间分辨的蛋白质组学分析。

免疫共沉淀产物：针对特定靶蛋白富集的互作蛋白复合物，用于研究信号通路和功能模块。

酶解肽段混合物：蛋白质经胰蛋白酶等消化后产生的肽段混合物，是质谱直接分析的常见样品形式。

磷酸化/糖基化肽段富集物：使用特异性抗体或材料富集修饰肽段，用于深度修饰组学分析。

合成多肽或重组蛋白：用于方法开发、标准曲线建立或特定蛋白的验证研究。

检测方法

液相色谱-串联质谱联用：核心平台技术，利用液相色谱分离肽段，再由串联质谱进行鉴定与定量。

鸟枪法蛋白质组学：将复杂蛋白质混合物酶解成肽段后进行LC-MS/MS分析，是主流的全局性分析策略。

数据依赖采集：最常用的串联质谱数据采集模式，根据一级谱强度选择前序离子进行碎裂。

数据非依赖采集：将质荷比窗口内的所有离子同时碎裂，无偏倚地采集所有肽段信息，重现性好。

等重标签标记技术：如TMT、iTRAQ，使用化学标签标记不同样品肽段，混合后上机实现多重定量。

非标记定量技术：基于质谱信号强度或谱图计数，直接比较不同LC-MS/MS运行中肽段的丰度。

靶向蛋白质组学：如选择反应监测/平行反应监测，特异性监测目标蛋白的特征肽段，实现高灵敏、高重复定量。

自上而下蛋白质组学：直接对完整蛋白质进行质谱分析，保留完整的修饰信息和蛋白变异体信息。

氢氘交换质谱：通过测量蛋白质在重水中氢氘交换速率，研究蛋白质结构动态和相互作用界面。

交联质谱：使用化学交联剂连接空间距离接近的氨基酸残基，通过质谱分析获得蛋白质三维结构或互作信息。

检测仪器设备

纳升液相色谱系统：提供高灵敏度肽段分离，采用细内径色谱柱和低流速，是深度蛋白质组学的关键。

高分辨轨道阱质谱仪：如Orbitrap系列，具有高分辨率、高质量精度和高灵敏度，是蛋白质组学的主流仪器。

四极杆-飞行时间质谱仪：具备快速扫描速度和高质量精度，常用于DIA分析和糖蛋白表征。

三重四极杆质谱仪：用于靶向蛋白质组学分析，通过SRM/MRM模式实现精准定量，灵敏度和特异性高。

离子淌度质谱仪：在传统质谱基础上增加离子淌度分离维度，提高复杂样品分离能力和鉴定深度。

基质辅助激光解吸电离源：常用于MALDI-TOF-MS，适合分析简单肽段混合物或成像研究。

电喷雾电离源：将液相流出物雾化成带电液滴并产生气相离子，是LC-MS/MS最常用的离子化接口。

高性能服务器与计算集群：用于存储海量质谱原始数据并进行数据库搜索和生物信息学分析。

自动化样品处理工作站：实现从样品裂解、还原烷基化、酶解到除盐的全流程或部分流程自动化，提高通量和重复性。

超声波细胞破碎仪：用于有效裂解细胞和组织，释放总蛋白质，是样品制备的第一步关键设备。

检测服务范围

1、指标检测：按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享：按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析：对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4，样品前处理：对产品进行预处理后，进行样品前处理，包括样品的采集与保存，样品的提取与分离，样品的鉴定以及样品的初步分析，通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析：根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测，然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。

合作客户展示

部分资质展示