检测项目

SNP检测:单核苷酸多态性位点识别,检测精度≥99.5%,假阳性率≤0.1%

InDel检测:1-50bp插入缺失变异分析,最低检出限≥5bp

CNV分析:拷贝数变异检测,分辨率达10kb,log2 ratio阈值±0.3

SV鉴定:结构变异检测类型覆盖缺失/重复/倒位/易位,置信度≥95%

杂合性缺失:LOH区域定位分析,最小检出区域100kb

线粒体基因组:mtDNA突变频率检测,覆盖度≥1000×

融合基因:染色体间重排事件验证,支持reads数≥5

HLA分型:高分辨率HLA-I/II类分型,准确率≥99%

变异注释:基于ClinVar/OMIM数据库的致病性评级

群体遗传:π值/Fst/选择清除分析,SNP密度≥1/100bp

甲基化分析:全基因组甲基化水平检测,CpG位点覆盖≥2百万

病毒整合:外源病毒序列定位,定位精度±500bp

检测范围

哺乳动物基因组:人/小鼠/大鼠等模式生物遗传变异图谱构建

作物育种材料:水稻/玉米/小麦等重要农艺性状关联分析

家畜遗传改良:牛/猪/鸡经济性状相关位点筛选

濒危物种保护:种群遗传多样性评估与近交系数计算

肿瘤样本检测:体细胞突变负荷与驱动基因鉴定

罕见病研究:孟德尔遗传病致病突变筛查

微生物基因组:细菌/真菌菌株进化关系重建

古DNA分析:降解样本低覆盖度全基因组测序

细胞系鉴定:交叉污染与遗传漂变监测

模式生物构建:基因编辑动物模型脱靶效应评估

检测标准

ISO/IEC 17025:2017 检测实验室通用要求

ISO 20395:2019 生物样本库质量规范

GB/T 29889.1-2013 高通量测序数据分析流程

GB/T 34798-2017 核酸测序文库制备质量要求

CLSI MM19-A2 肿瘤基因检测指南

ACMG SF v3.0 临床变异解读指南

FASTQ格式遵循Illumina BaseSpace标准

BAM文件生成符合GATK Best Practices

VCF 4.2标准变异格式输出

ENCODE项目表观遗传分析流程

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000测序仪:双通道流动槽,单次运行通量达6Tb,支持PE150测序模式

Thermo Fisher Ion S5 XL系统:半导体测序芯片,单次运行产出15Gb,适用于靶向验证

Nanopore PromethION 48:纳米孔实时测序,最长读长>100kb,用于复杂结构变异解析

Agilent 4200 TapeStation:自动化电泳系统,DNA片段分布检测精度±5bp

Covaris M220聚焦超声仪:DNA打断范围150-500bp可控,CV值≤8%

Beckman Coulter Biomek i7:自动化移液工作站,文库构建通量96样本/批次

Qubit 4.0 Fluorometer:双通道荧光检测,DNA定量检测限0.5-60ng/μL

NVIDIA DGX A100计算平台:8×A100 GPU加速分析,变异检测速度提升20倍

检测服务范围

1、指标检测:按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享:按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析:对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4,样品前处理:对产品进行预处理后,进行样品前处理,包括样品的采集与保存,样品的提取与分离,样品的鉴定以及样品的初步分析,通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析:根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测,然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。