细胞转录组测序检测

检测项目

RNA完整性检测：测量RNA完整性数（RIN）值范围1-10，使用电泳或微流控技术评估样本降解程度，确保RIN≥7为合格标准。

RNA浓度和纯度检测：通过紫外分光光度法测定A260/A280比值范围1.8-2.0，A260/A230比值>2.0，量化总RNA浓度在0.1-1000 ng/μL。

文库大小分布检测：利用生物分析仪分析cDNA文库片段大小范围150-700 bp，变异系数<5%，确保文库均匀性。

测序深度检测：计算平均覆盖深度参数≥30×，针对参考基因组区域，覆盖率>95%，支持低丰度转录本检出。

比对率检测：评估原始reads比对到参考基因组的百分比>90%，使用比对软件参数如mismatch允许率<2%和插入缺失长度<5 bp。

基因表达量化检测：计算标准化表达值如FPKM（Fragments Per Kilobase Million）或TPM（Transcripts Per Million），范围0.01-1000，精度±0.5。

差异表达基因分析：鉴定fold change绝对值>2且p-value<0.05的基因，使用统计模型如DESeq2或edgeR进行多重检验校正。

功能富集分析：执行GO（Gene Ontology）或KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）富集，p-value<0.05，富集因子>2，识别生物学通路。

可变剪切检测：分析剪切事件如外显子跳跃或内含子保留，检测率>95%，使用软件参数支持≥2个异构体鉴别。

新转录本预测检测：基于de novo组装预测新基因或转录本，要求覆盖长度>200 bp，置信度评分>0.8。

质量控制指标检测：评估测序数据质量如Q30值（碱基质量分数≥30）比例>80%，错误率<0.1% per base。

批次效应校正检测：应用标准化方法如ComBat减少实验间变异，参数包括变异系数降低>50%，确保数据可比性。

表达谱稳定性检测：计算管家基因（如GAPDH）表达变异系数<10%，验证实验重复性。

RNA编辑检测：识别A-to-I或C-to-U编辑位点，检出率>90%，编辑频率范围0.1-100%。

融合基因检测：分析染色体易位事件，要求支持reads数≥5，置信度>0.95，覆盖断裂点区域。

表达相关性检测：计算样本间Pearson相关系数>0.9，评估技术重复一致性。

低丰度转录本检测：优化检出限至0.01 FPKM，使用扩增方法提高灵敏度。

RNA病毒检测：筛查病毒序列比对率>5%，支持病原体鉴定。

表观转录组分析：检测RNA修饰如m6A，修饰位点覆盖深度≥20×。

单细胞异质性检测：分析细胞簇间差异，使用t-SNE或UMAP降维，分辨率>0.5。

检测范围

人类肿瘤细胞样本：用于癌症机制研究，检测基因突变和表达失调，支持个性化医疗。

植物组织样本：分析作物胁迫响应，如干旱或病虫害下的转录组变化，优化育种策略。

动物胚胎发育样本：研究发育阶段特异性表达，追踪细胞分化过程。

微生物群落样本：评估环境或宿主相关微生物的代谢活动，应用于生态研究。

神经细胞样本：探索脑部疾病如阿尔茨海默病的分子基础，识别潜在靶点。

免疫细胞样本：分析免疫响应通路，如T细胞激活状态，支持疫苗开发。

干细胞样本：研究多能性维持机制，指导再生医学应用。

临床血液样本：用于无创诊断，检测循环肿瘤RNA或疾病标志物。

药物处理细胞样本：评估化合物效应，筛选药物候选物。

环境应激样本：如重金属暴露下的生物响应，应用于毒理学研究。

单细胞分离样本：实现细胞水平转录组分析，揭示细胞亚群异质性。

古生物样本：从化石材料提取RNA，研究进化过程。

器官类样本：如肝脏或心脏组织，分析器官功能转录调控。

病毒宿主样本：检测病毒感染后的宿主基因表达变化。

转基因生物样本：验证基因编辑效果，评估表达沉默或过表达。

衰老模型样本：研究年龄相关表达谱，探索抗衰老机制。

代谢疾病样本：如糖尿病组织，分析代谢通路失调。

感染性疾病样本：筛查病原体RNA，支持流行病学调查。

植物-微生物互作样本：研究共生或寄生关系中的基因表达。

细胞培养样本：优化培养基条件下表达分析，应用于生物制造。

检测标准

依据ISO 20395:2019规范下一代测序术语和质控要求，确保数据完整性。

遵循GB/T 30988-2014标准进行RNA样本提取和质量评估，规定纯度阈值。

采用ASTM E2314指南用于高通量表达数据验证，要求重复性测试。

参考ISO 17025准则实施实验室能力验证，覆盖测序全流程。

应用GB/T 36600-2018规定生物信息学分析流程，包括比对和差异表达算法。

依据EN ISO 15189标准进行临床样本处理，确保诊断可靠性。

采用ISO 5725-2规范方法学精密度评估，支持结果可比性。

参考GB/T 1.1-2020制定检测报告格式，要求数据透明化。

遵循ISO 13485标准用于医疗器械相关样本检测，强调风险管理。

依据ASTM D4447指南进行环境样本RNA稳定性测试，规定储存条件。

采用GB/T 28046-2011规范汽车电子样本的转录组分析，应用于工业研究。

参考ISO 9001质量管理体系，确保检测过程标准化。

依据GB/T 22278-2008进行食品安全相关样本检测，规定污染物筛查。

采用ISO 14001环境管理体系，支持可持续检测实践。

参考ASTM E2554标准进行数据统计分析，要求置信区间计算。

检测仪器

高通量测序仪：采用边合成边测序技术，功能为执行大规模RNA测序，生成数百万reads用于转录本定量。

生物分析仪：基于微流控芯片原理，功能为检测RNA完整性和文库大小分布，提供电泳图谱和质量评分。

紫外分光光度计：利用光吸收测量原理，功能为量化RNA浓度和纯度，确保样本A260/A280比值符合标准。

实时定量PCR仪：通过荧光检测扩增曲线，功能为验证文库构建效率和基因表达水平，支持低丰度目标检出。

生物信息学服务器：运行高性能计算集群，功能为处理测序数据，执行比对、差异表达分析和富集计算。

自动化液体处理系统：采用机械臂移液技术，功能为标准化样本制备和文库构建，减少人为误差。

冷冻离心机：基于高速旋转分离原理，功能为RNA提取过程中的细胞裂解和沉淀，确保样本纯净。

纳米孔测序设备：使用电信号检测技术，功能为实时长读长测序，支持新转录本发现和可变剪切分析。

细胞分选仪：结合流式细胞术，功能为单细胞分离，应用于单细胞转录组样本制备。

恒温孵育器：维持稳定温度环境，功能为RNA反转录和扩增步骤，优化反应效率。

检测服务范围

1、指标检测：按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享：按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析：对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4，样品前处理：对产品进行预处理后，进行样品前处理，包括样品的采集与保存，样品的提取与分离，样品的鉴定以及样品的初步分析，通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析：根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测，然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。

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