检测项目

RNA完整性检测:使用RIN值评估样本质量,检测范围1-10,合格标准RIN≥7.0

总RNA浓度与纯度测定:紫外分光光度法检测,要求A260/A280比值1.8-2.0,A260/A230≥2.0

mRNA富集效率验证:真核样本polyA尾捕获率≥90%,原核样本rRNA去除率≥95%

cDNA文库构建质量评估:片段分布检测范围150-500bp,主峰CV值≤15%

高通量测序深度控制:人类基因组推荐深度≥30M clean reads/样本

基因表达定量分析:采用FPKM/TPM标准化算法,检测灵敏度0.01TPM

差异表达基因筛选:Fold Change≥2且FDR≤0.05为显著性阈值

可变剪接事件分析:使用rMATS软件检测,置信度PSI值变化≥10%

融合基因检测:支持断点定位精度±5bp,阳性预测值≥85%

新转录本预测:要求全长覆盖率≥80%,FPKM≥1

功能富集分析:GO/KEGG注释采用超几何检验,p值≤0.05

lncRNA鉴定:编码潜能评估CPC评分≤-1,PhyloCSF≤0

检测范围

临床病理样本:FFPE组织切片(厚度≥5μm)、新鲜冰冻组织(RNAlater保存)、外周血PBMC分离细胞

植物生理研究材料:叶片组织(避光速冻)、根系样本(液氮研磨)、果实发育期系列样本

微生物菌群分析:环境微生物宏转录组(滤膜直径0.22μm)、肠道菌群粪便样本(-80℃保存)

药物研发样本:药物处理细胞系(3个生物学重复)、给药动物器官组织(离体15min内速冻)

胚胎发育研究:斑马鱼胚胎分期样本(受精后0-72h)、小鼠妊娠期胚胎(E12.5-E18.5)

肿瘤分子分型:穿刺活检样本(RNase free处理)、循环肿瘤细胞(CTC富集纯度≥70%)

免疫学研究:T细胞亚群分选样本(流式分选纯度≥95%)、细胞因子刺激时间序列

神经科学样本:脑区显微切割组织(重量≥5mg)、脑脊液exosome提取RNA

作物育种材料:胁迫处理植株(干旱/盐碱处理组)、杂交后代群体单株

模式生物发育研究:果蝇蛹期时序样本、线虫龄期同步化群体

检测标准

ISO 20395:2019 生物技术-核酸测序方法要求

GB/T 34796-2017 高通量基因测序样本制备质量要求

EN ISO 18184:2019 纺织品中病毒灭活RNA检测法

GB/T 38551-2020 高通量转录组测序数据分析通则

ISO 20184-1:2018 冷冻组织样本RNA提取规范

ASTM E3133-18 测序文库质量评估标准指南

YY/T 1595-2017 人表皮生长因子受体基因表达谱检测

FDA Bioanalyzer系统质控标准(21CFR Part11)

Illumina测序平台SOP(2023版)质量参数

TCGA数据库RNA-Seq分析流程v2.0

检测仪器

高通量测序系统:采用边合成边测序技术,通量≥1000Gb/run,支持单细胞转录组建库

生物分析仪系统:基于微流控芯片技术,检测范围25-5000nt,分辨率±5bp

实时荧光定量PCR仪:用于RNA质检及验证,检测动态范围1-10^9拷贝,精度±0.1Cq值

超速冷冻离心机:配备角转子和水平转子,最大RCF≥100,000×g,温控精度±1℃

超声波破碎仪:细胞裂解专用,频率20kHz,功率调节范围5-500W

自动化液体工作站:移液精度0.1μL,支持96/384孔板操作,CV值≤2%

低温恒温金属浴:温度范围-10℃~100℃,控温精度±0.3℃

超微量分光光度计:检测下限0.2ng/μL,光程0.05mm

程序降温冷冻箱:降温速率1℃/min可控,温度均一性±2℃

真空冷冻干燥机:冷阱温度≤-80℃,极限真空≤10Pa

检测服务范围

1、指标检测:按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享:按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析:对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4,样品前处理:对产品进行预处理后,进行样品前处理,包括样品的采集与保存,样品的提取与分离,样品的鉴定以及样品的初步分析,通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析:根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测,然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。