转录组组学检测
发布时间:2025-06-30
转录组组学检测通过对生物样本中全部RNA分子的定性与定量分析,揭示基因表达动态及调控机制。核心要点包括RNA提取质量控制、文库构建合规性、高通量测序深度控制、生物信息学分析流程标准化以及差异表达基因功能注释的准确性验证。
注意:因业务调整,暂不接受个人委托测试望见谅。
检测项目
RNA完整性检测:使用RIN值评估样本质量,检测范围1-10,合格标准RIN≥7.0
总RNA浓度与纯度测定:紫外分光光度法检测,要求A260/A280比值1.8-2.0,A260/A230≥2.0
mRNA富集效率验证:真核样本polyA尾捕获率≥90%,原核样本rRNA去除率≥95%
cDNA文库构建质量评估:片段分布检测范围150-500bp,主峰CV值≤15%
高通量测序深度控制:人类基因组推荐深度≥30M clean reads/样本
基因表达定量分析:采用FPKM/TPM标准化算法,检测灵敏度0.01TPM
差异表达基因筛选:Fold Change≥2且FDR≤0.05为显著性阈值
可变剪接事件分析:使用rMATS软件检测,置信度PSI值变化≥10%
融合基因检测:支持断点定位精度±5bp,阳性预测值≥85%
新转录本预测:要求全长覆盖率≥80%,FPKM≥1
功能富集分析:GO/KEGG注释采用超几何检验,p值≤0.05
lncRNA鉴定:编码潜能评估CPC评分≤-1,PhyloCSF≤0
检测范围
临床病理样本:FFPE组织切片(厚度≥5μm)、新鲜冰冻组织(RNAlater保存)、外周血PBMC分离细胞
植物生理研究材料:叶片组织(避光速冻)、根系样本(液氮研磨)、果实发育期系列样本
微生物菌群分析:环境微生物宏转录组(滤膜直径0.22μm)、肠道菌群粪便样本(-80℃保存)
药物研发样本:药物处理细胞系(3个生物学重复)、给药动物器官组织(离体15min内速冻)
胚胎发育研究:斑马鱼胚胎分期样本(受精后0-72h)、小鼠妊娠期胚胎(E12.5-E18.5)
肿瘤分子分型:穿刺活检样本(RNase free处理)、循环肿瘤细胞(CTC富集纯度≥70%)
免疫学研究:T细胞亚群分选样本(流式分选纯度≥95%)、细胞因子刺激时间序列
神经科学样本:脑区显微切割组织(重量≥5mg)、脑脊液exosome提取RNA
作物育种材料:胁迫处理植株(干旱/盐碱处理组)、杂交后代群体单株
模式生物发育研究:果蝇蛹期时序样本、线虫龄期同步化群体
检测标准
ISO 20395:2019 生物技术-核酸测序方法要求
GB/T 34796-2017 高通量基因测序样本制备质量要求
EN ISO 18184:2019 纺织品中病毒灭活RNA检测法
GB/T 38551-2020 高通量转录组测序数据分析通则
ISO 20184-1:2018 冷冻组织样本RNA提取规范
ASTM E3133-18 测序文库质量评估标准指南
YY/T 1595-2017 人表皮生长因子受体基因表达谱检测
FDA Bioanalyzer系统质控标准(21CFR Part11)
Illumina测序平台SOP(2023版)质量参数
TCGA数据库RNA-Seq分析流程v2.0
检测仪器
高通量测序系统:采用边合成边测序技术,通量≥1000Gb/run,支持单细胞转录组建库
生物分析仪系统:基于微流控芯片技术,检测范围25-5000nt,分辨率±5bp
实时荧光定量PCR仪:用于RNA质检及验证,检测动态范围1-10^9拷贝,精度±0.1Cq值
超速冷冻离心机:配备角转子和水平转子,最大RCF≥100,000×g,温控精度±1℃
超声波破碎仪:细胞裂解专用,频率20kHz,功率调节范围5-500W
自动化液体工作站:移液精度0.1μL,支持96/384孔板操作,CV值≤2%
低温恒温金属浴:温度范围-10℃~100℃,控温精度±0.3℃
超微量分光光度计:检测下限0.2ng/μL,光程0.05mm
程序降温冷冻箱:降温速率1℃/min可控,温度均一性±2℃
真空冷冻干燥机:冷阱温度≤-80℃,极限真空≤10Pa
检测服务范围
1、指标检测:按国标、行标及其他规范方法检测
2、仪器共享:按仪器规范或用户提供的规范检测
3、主成分分析:对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。
4,样品前处理:对产品进行预处理后,进行样品前处理,包括样品的采集与保存,样品的提取与分离,样品的鉴定以及样品的初步分析,通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;
5、深度分析:根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测,然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。

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