转录组组学检测

检测项目

RNA完整性检测：使用RIN值评估样本质量，检测范围1-10，合格标准RIN≥7.0

总RNA浓度与纯度测定：紫外分光光度法检测，要求A260/A280比值1.8-2.0，A260/A230≥2.0

mRNA富集效率验证：真核样本polyA尾捕获率≥90%，原核样本rRNA去除率≥95%

cDNA文库构建质量评估：片段分布检测范围150-500bp，主峰CV值≤15%

高通量测序深度控制：人类基因组推荐深度≥30M clean reads/样本

基因表达定量分析：采用FPKM/TPM标准化算法，检测灵敏度0.01TPM

差异表达基因筛选：Fold Change≥2且FDR≤0.05为显著性阈值

可变剪接事件分析：使用rMATS软件检测，置信度PSI值变化≥10%

融合基因检测：支持断点定位精度±5bp，阳性预测值≥85%

新转录本预测：要求全长覆盖率≥80%，FPKM≥1

功能富集分析：GO/KEGG注释采用超几何检验，p值≤0.05

lncRNA鉴定：编码潜能评估CPC评分≤-1，PhyloCSF≤0

检测范围

临床病理样本：FFPE组织切片（厚度≥5μm）、新鲜冰冻组织（RNAlater保存）、外周血PBMC分离细胞

植物生理研究材料：叶片组织（避光速冻）、根系样本（液氮研磨）、果实发育期系列样本

微生物菌群分析：环境微生物宏转录组（滤膜直径0.22μm）、肠道菌群粪便样本（-80℃保存）

药物研发样本：药物处理细胞系（3个生物学重复）、给药动物器官组织（离体15min内速冻）

胚胎发育研究：斑马鱼胚胎分期样本（受精后0-72h）、小鼠妊娠期胚胎（E12.5-E18.5）

肿瘤分子分型：穿刺活检样本（RNase free处理）、循环肿瘤细胞（CTC富集纯度≥70%）

免疫学研究：T细胞亚群分选样本（流式分选纯度≥95%）、细胞因子刺激时间序列

神经科学样本：脑区显微切割组织（重量≥5mg）、脑脊液exosome提取RNA

作物育种材料：胁迫处理植株（干旱/盐碱处理组）、杂交后代群体单株

模式生物发育研究：果蝇蛹期时序样本、线虫龄期同步化群体

检测标准

ISO 20395:2019 生物技术-核酸测序方法要求

GB/T 34796-2017 高通量基因测序样本制备质量要求

EN ISO 18184:2019 纺织品中病毒灭活RNA检测法

GB/T 38551-2020 高通量转录组测序数据分析通则

ISO 20184-1:2018 冷冻组织样本RNA提取规范

ASTM E3133-18 测序文库质量评估标准指南

YY/T 1595-2017 人表皮生长因子受体基因表达谱检测

FDA Bioanalyzer系统质控标准（21CFR Part11）

Illumina测序平台SOP（2023版）质量参数

TCGA数据库RNA-Seq分析流程v2.0

检测仪器

高通量测序系统：采用边合成边测序技术，通量≥1000Gb/run，支持单细胞转录组建库

生物分析仪系统：基于微流控芯片技术，检测范围25-5000nt，分辨率±5bp

实时荧光定量PCR仪：用于RNA质检及验证，检测动态范围1-10^9拷贝，精度±0.1Cq值

超速冷冻离心机：配备角转子和水平转子，最大RCF≥100,000×g，温控精度±1℃

超声波破碎仪：细胞裂解专用，频率20kHz，功率调节范围5-500W

自动化液体工作站：移液精度0.1μL，支持96/384孔板操作，CV值≤2%

低温恒温金属浴：温度范围-10℃~100℃，控温精度±0.3℃

超微量分光光度计：检测下限0.2ng/μL，光程0.05mm

程序降温冷冻箱：降温速率1℃/min可控，温度均一性±2℃

真空冷冻干燥机：冷阱温度≤-80℃，极限真空≤10Pa

检测服务范围

1、指标检测：按国标、行标及其他规范方法检测

2、仪器共享：按仪器规范或用户提供的规范检测

3、主成分分析：对含量高的组分或你所规定的某种组分进行5~7天检测。

4，样品前处理：对产品进行预处理后，进行样品前处理，包括样品的采集与保存，样品的提取与分离，样品的鉴定以及样品的初步分析，通过逆向剖析确定原料化学名称及含量等共10个步骤;

5、深度分析：根据成分分析对采购的原料标准品做准确的定性定量检测，然后给出参考工艺及原料的推荐。最后对产品的质量控制及生产过程中出现问题及时解决。

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